Em Harmonies, crie paisagens colocando fichas coloridas e crie habitats para os seus animais. Para ganhar o máximo de pontos e vencer o jogo, incorpore os habitats nas suas paisagens de forma inteligente e tenha o máximo de animais que puder para lá se instalarem.
Começando pelo primeiro jogador e seguindo no sentido dos ponteiros do relógio, cada jogador escolherá um conjunto de 3 fichas de terreno da área central para colocar no seu tabuleiro pessoal. Opcionalmente, podem escolher uma carta de Animal das 5 exibidas e/ou colocar um cubo de Animal da(s) sua(s) carta(s) de Animal em quaisquer padrões concluídos no seu tabuleiro que correspondam às suas cartas de Animal pessoais. Há um limite de 4 cartas por jogador. Após a sua vez, reabasteça com um novo conjunto de 3 fichas e uma nova carta de Animal, se necessário.
A colocação das fichas de terreno dependerá dos objetivos das cartas de Animal pessoais e das regras de pontuação para os vários tipos de terreno (montanha, campo, floresta, etc.). Por exemplo, as fichas de montanha pontuam com base na sua altura (1 ficha pontua 1, enquanto 3 fichas empilhadas pontuam 7), mas a montanha pontua zero se não estiver adjacente a pelo menos uma outra montanha. Se todos os cubos de uma dada carta de Animal tiverem sido colocados, a carta é posta de lado e uma nova carta pode ser comprada. As cartas são pontuadas no final do jogo com base no número mais alto que não está coberto por um cubo.
Os jogos terminam quando não há mais fichas na bolsa para reabastecer a área central, ou pelo menos um jogador tem 2 ou menos espaços vazios no seu tabuleiro de jogador. O jogo continua até que todos os jogadores tenham tido uma vez igual nessa ronda. O jogador com mais pontos é o vencedor.
Opcionalmente, pode usar cartas de Espírito da Natureza para uma jogabilidade mais rica. Durante a configuração, cada jogador escolhe 1 de 2 cartas de espírito e coloca um cubo de Espírito na carta. Seguem as mesmas regras de colocação que as cartas de Animal, mas tendem a ter um efeito contínuo uma vez concluídas. A carta de espírito conta para o limite de 4 cartas na mão.